基础生物化学原理

本书是南京大学杨荣武教授主编的《生物化学原理》第3版的简明版，重点介绍了生物化学最核心的内容，具有脉络清晰、内容新、概念性强、简洁、易懂、有趣等特点。全书共分20章，内容涉及结构生物化学、代谢生物化学和分子生物学的基本内容。本书继承了《生物化学原理》的很多特色，每章包括引言、主题内容、小框故事、小测验、思考题等，另配有丰富的数字课程资源，如各章小结、授课音视频、教学课件、小测验和思考题答案等。本书可作为高等综合性、医学及农林院校生命科学类专业本科生的教材，也可供相关专业的教师、研究生和科技工作者参考。

目录
- 前辅文
- 第一篇结构生物化学
  - 第一章绪论
    - 第一节生物化学发展简史
      - Box1.1 生化趣事——年度分子和年度突破
    - 第二节生物化学的主要内容及其应用
    - 第三节生物化学学习方法
      - 科学故事中国科学家是如何在世界上率先人工合成出蛋白质的？
  - 第二章蛋白质的结构与功能
    - 第一节氨基酸
      - 一、氨基酸的结构和分类
      - 二、氨基酸的性质
      - 三、氨基酸的功能
      - Box2.1 “硒代半胱氨酸”的发现故事
    - 第二节蛋白质的结构
      - 一、蛋白质的一级结构
      - 二、蛋白质的二级结构
      - 三、蛋白质的三级结构
      - 四、蛋白质的四级结构
      - 五、蛋白质的折叠
      - Box2.2 细胞是如何清除胞外错误折叠的蛋白质的？
    - 第三节蛋白质的功能及其与结构的关系
      - 一、蛋白质的主要功能
      - 二、蛋白质结构与功能关系的一般规则
      - 三、几种重要的蛋白质的功能及其与结构的关系
      - Box2.3 魔鬼蠕虫的生存之道
    - 第四节蛋白质的性质与分类
      - 一、蛋白质的性质
      - 二、蛋白质的分类
      - Box2.4 科学家发现“英雄蛋白”啦！
    - 第五节蛋白质的研究方法
      - 一、蛋白质的分离和纯化
      - 二、蛋白质大小的确定
      - 三、蛋白质等电点的测定
      - 四、蛋白质在机体内表达的分析
      - 五、蛋白质一级结构的测定
      - 六、蛋白质三维结构的确定
      - 七、蛋白质功能的研究
      - Box2.5 将来能用纳米孔测定蛋白质一级结构吗？
      - 科学故事科学家是如何发现一种罕见的Hb突变体的作用机理的？
  - 第三章核酸的结构与功能
    - 第一节核苷酸
      - 一、核苷酸的结构
      - 二、核苷酸的性质
      - 三、核苷酸的功能
      - Box3.1 mRNA分子中的第五个碱基
    - 第二节核酸的结构
      - 一、RNA和DNA的结构比较
      - 二、核酸的一级结构
      - 三、核酸的二级结构
      - 四、核酸的三级结构
      - 五、核酸与蛋白质形成的复合物
      - Box3.2 DNA究竟能不能形成正平行的双螺旋？
    - 第三节核酸的功能
      - Box3.3 tRNA的新功能
    - 第四节核酸的性质
      - Box3.4 破解“水熊虫”在极端环境中生存的秘密
    - 第五节核酸的研究方法
      - 一、核酸的分离、纯化和定量
      - 二、核酸一级结构的测定
      - Box3.5 “Chargaff法则”的发现故事
      - 科学故事 DNA双螺旋结构的发现
  - 第四章酶的结构与功能
    - 第一节酶学概论
      - 一、酶的化学本质
      - 二、酶的催化性质
      - 三、酶的分类和命名
      - Box4.1 立体专一性的例外及其解释
    - 第二节酶动力学
      - 一、影响酶促反应速率的因素
      - 二、米氏动力学
      - 三、米氏酶抑制剂作用的动力学
      - 四、别构酶的动力学
      - Box4.2 洋葱为什么能“催人泪下”？
    - 第三节酶的催化机制
      - 一、过渡态稳定学说
      - 二、过渡态稳定的化学机制
      - 三、几种蛋白酶的结构与功能
      - Box4.3 揭开黄素单加氧酶的神秘面纱
    - 第四节酶活性的调节
      - 一、酶的“量变”调节机制
      - 二、酶的“质变”调节机制
      - Box4.4 能量感应器AMPK也能当无间道？
    - 第五节维生素与辅酶
      - 一、水溶性维生素
      - 二、脂溶性维生素
      - Box4.5 维生素A和C可帮助消除细胞记忆
    - 第六节酶的研究方法
      - 一、酶活力的测定
      - 二、酶的分离和纯化
      - 三、酶工程
      - 科学故事核酶的发现
  - 第五章糖类与脂质的结构与功能
    - 第一节糖类
      - 一、单糖
      - 二、寡糖
      - 三、多糖
      - Box5.1 科学家在坠落到地球的陨石中发现了糖
    - 第二节脂质
      - 一、简单脂
      - 二、复合脂
      - 三、异戊二烯类脂
      - Box5.2 小心反式脂肪！
    - 第三节糖缀合物
      - 一、糖蛋白和蛋白聚糖
      - 二、肽聚糖
      - 三、脂多糖
      - 科学故事改变教科书的发现：受精过程中，卵子不再被动！
  - 第六章激素的结构与功能
    - 第一节激素的一般性质
      - 一、激素的定义
      - 二、激素的化学本质及分类
      - 三、激素的定量
    - 第二节激素作用的一般特征
      - 一、特异性
      - 二、高效性
      - 三、可能需要“第二信使”
      - 四、可能产生“快反应”或“慢反应”
      - 五、脱敏性
      - 六、时效性
      - Box6.1 猫能尝到甜味和苦味吗？
    - 第三节激素作用的详细机制
      - 一、脂溶性激素的作用机制
      - 二、水溶性激素的作用机制
      - 三、信号的终止
      - Box6.2 用光激活细胞产生胰岛素来治疗糖尿病
    - 第四节激素作用的整合
      - 科学故事蛋白质“可逆磷酸化”的发现
- 第二篇代谢生物化学
  - 第七章代谢总论
    - 第一节代谢的基本概念
    - 第二节代谢的基本特征
      - Box7.1 红细胞特殊结构的生化意义
    - 第三节代谢研究的主要内容和方法
    - 第四节代谢组和代谢组学
      - 科学故事真核生物最近的共同祖先找到啦！
  - 第八章生物能学与生物氧化
    - 第一节生物能学
      - 一、热力学定律与Gibbs-Helmholtz方程
      - 二、生化反应的方向性与自由能之间的关系
      - 三、ΔG与ΔE之间的关系
      - 四、生命系统内的偶联反应
      - 五、高能生物分子
      - Box8.1 ATP能不能进出细胞？
    - 第二节生物氧化
      - 一、呼吸链
      - 二、氧化磷酸化
      - 三、质子梯度产生的机制
      - 四、质子梯度驱动ATP合成的分子机制
      - 五、氧化磷酸化的抑制
      - 六、氧化磷酸化的调节
      - Box8.2 小心米酵菌酸
      - 科学故事瘤胃微生物组中发现新的代谢途径，Na+梯度也可驱动ATP合成！
  - 第九章糖代谢
    - 第一节糖类在动物消化道内的消化和吸收
      - 一、多糖和寡糖的酶促降解
      - 二、单糖的吸收和转运
      - Box9.1 动物细胞内的溶酶体万一破裂了会发生什么？
    - 第二节糖酵解
      - 一、糖酵解的全部反应
      - 二、NADH和丙酮酸的命运
      - 三、其他物质进入糖酵解
      - 四、糖酵解的生理功能
      - 五、糖酵解的调节
      - Box9.2 去高海拔地区，人体内2，3-BPG水平为什么会升高？
    - 第三节三羧酸循环
      - 一、三羧酸循环的发现
      - 二、三羧酸循环的全部反应
      - 三、三羧酸循环的生理功能
      - 四、乙醛酸循环
      - 五、三羧酸循环的回补反应
      - 六、TCA循环的调控
    - 第四节磷酸戊糖途径
      - 一、PPP的全部反应
      - 二、PPP的功能
      - Box9.3 大肠杆菌已经被改造成自养生物，你信吗？
    - 第五节糖异生
      - 一、糖异生的原料
      - 二、糖异生的全部反应
      - 三、其他物质进入糖异生
      - 四、糖异生的能量消耗
      - 五、糖异生的生理功能
      - 六、糖异生的调节
      - Box9.4 为什么猫不能吃阿司匹林？
    - 第六节糖原代谢
      - 一、糖原的分解
      - 二、糖原的合成
      - 三、糖原代谢的调节
    - 第七节光合作用
      - 一、光合作用的基本过程
      - 二、植物光合作用的细胞器——叶绿体
      - 三、光反应
      - 四、暗反应
      - 五、卡尔文循环的调节
      - Box9.5 古代基于铁硫簇的机制可监测光合作用中的电子流
      - 科学故事糖酵解的发现
  - 第十章脂代谢
    - 第一节脂质在动物消化道内的消化和吸收
      - 一、脂质的酶促降解
      - 二、脂质的吸收
    - 第二节脂肪、磷脂和糖脂在细胞内的代谢
      - 一、脂肪代谢
      - 二、磷脂代谢
      - 三、糖脂代谢
      - Box10.1 毛喉素可以帮助我们瘦身减肥吗？
    - 第三节脂肪酸代谢
      - 一、脂肪酸的分解
      - 二、脂肪酸的合成
      - 三、脂肪酸代谢的调控
      - Box10.2 真核生物体内连接糖代谢和脂代谢的关键酶的3D结构终于被解析出来啦！
    - 第四节胆固醇代谢
      - 一、胆固醇的合成
      - 二、胆固醇的转运
      - 三、胆固醇合成的调节
      - 科学故事 LDL受体的发现
  - 第十一章氨基酸代谢
    - 第一节蛋白质在动物消化道内的消化和吸收
    - 第二节氨基酸的分解
      - 一、氨基的代谢
      - 二、氨的进一步代谢转变
      - 三、碳骨架的代谢
    - 第三节氨基酸及其衍生物的合成
      - 科学故事科学家发现海洋中微小硅藻也有尿素循环
  - 第十二章核苷酸代谢
    - 第一节核酸在动物消化道内的消化和吸收
    - 第二节核苷酸的合成
      - 一、核苷酸的从头合成
      - 二、核苷酸的补救合成
      - 三、NDP和NTP的合成
      - 四、脱氧核苷酸的合成
      - 五、dTMP的合成
    - 第三节核苷酸合成的调控
      - 一、嘌呤核苷酸合成的调节
      - 二、嘧啶核苷酸合成的调节
      - 三、脱氧核苷酸合成的调节
      - Box12.1 Miller-Urey实验的升级
    - 第四节核苷酸的分解
      - 一、嘌呤核苷酸的分解
      - 二、嘧啶核苷酸的分解
    - 第五节几种与核苷酸代谢异常相关的疾病
      - 一、痛风
      - 二、重症联合免疫缺陷病
      - 三、Lesch-Nyhan综合征
      - 四、乳清酸尿症
      - 科学故事核糖核苷酸还原酶的发现
- 第三篇分子生物学
  - 第十三章 DNA复制
    - 第一节 DNA复制的一般特征
      - Box13.1 胞内DNA复制前导链的合成是绝对连续的吗？
    - 第二节参与DNA复制的主要酶和蛋白质
      - 一、DNA聚合酶
      - 二、DNA解链酶
      - 三、SSB
      - 四、DNA拓扑异构酶
      - 五、DNA引发酶
      - 六、切除引物的酶
      - 七、DNA连接酶
      - 八、端粒酶
    - 第三节 DNA复制的详细机制
      - 一、以大肠杆菌为代表的细菌基因组DNA的“θ-复制”
      - 二、“滚环复制”
      - 三、D环复制
      - 四、真核细胞的细胞核DNA复制
      - 五、古菌的DNA复制
      - 科学故事 DNA聚合酶Ⅰ的发现之路
  - 第十四章 DNA的损伤、修复和突变
    - 第一节 DNA的损伤
      - 一、导致DNA损伤的因素
      - 二、DNA损伤的类型
      - Box14.1 真酒和假酒一样对健康有害
    - 第二节 DNA的修复
      - 一、直接修复
      - 二、切除修复
      - 三、双链断裂修复
      - 四、损伤跨越
    - 第三节 DNA的突变
      - 一、突变的类型与后果
      - 二、突变的原因
      - 三、回复突变与突变的校正
      - Box14.2 “沉默突变”也会导致疾病
      - 科学故事大肠杆菌DNA聚合酶Ⅳ和Ⅴ的发现之路
  - 第十五章 DNA重组
    - 第一节同源重组
      - 一、同源重组的模型
      - 二、参与同源重组的主要酶和蛋白质
      - 三、细菌的同源重组
    - 第二节位点特异性重组
      - 一、λ噬菌体DNA的位点特异性整合
      - 二、鼠伤寒沙门菌鞭毛抗原的转换
      - Box15.1 Cre-LoxP重组系统及其改造和应用
    - 第三节转座重组
      - 一、细菌的转座
      - 二、真核生物的转座
      - 三、古菌的转座
      - 四、转座的分子机制
      - 五、转座作用的调节
      - Box15.2 又有新的天然核酶被发现啦！
      - 科学故事 “跳跃基因”功能的新发现
  - 第十六章 DNA转录与转录后加工
    - 第一节 DNA转录的一般特征
    - 第二节依赖DNA的RNA聚合酶
      - 一、细菌的RNA聚合酶
      - 二、真核生物的RNA聚合酶
      - 三、古菌的RNA聚合酶
    - 第三节细菌的DNA转录
      - 一、转录的起始
      - 二、转录的延伸
      - 三、转录的终止
      - Box16.1 激活“睡眠”中的σ因子的新机制
    - 第四节真核生物基因的转录
      - 一、真核细胞核基因的转录
      - 二、线粒体DNA的转录
      - 三、叶绿体DNA的转录
    - 第五节古菌的DNA转录
    - 第六节转录后加工
      - 一、mRNA的后加工
      - 二、rRNA的后加工
      - 三、tRNA的后加工
      - 科学故事依赖DNA的RNA聚合酶的发现之路
  - 第十七章 RNA的复制
    - 第一节依赖于RNA的RNA复制
      - 一、双链RNA病毒的RNA复制
      - 二、单链RNA病毒的RNA复制
    - 第二节以DNA为中间物的RNA复制
      - 一、逆转录病毒的RNA复制
      - 二、逆转座子
      - 三、端聚酶催化的逆转录反应
      - 四、某些DNA病毒生活史中的逆转录现象
      - Box17.1 并非所有病毒都是敌人
      - 科学故事逆转录酶的发现
  - 第十八章 mRNA的翻译及其后加工
    - 第一节参与翻译的主要生物大分子以及复合物
      - 一、核糖体
      - 二、mRNA
      - 三、tRNA
      - 四、氨酰tRNA合成酶
      - 五、辅助蛋白因子
    - 第二节翻译的一般特征
    - 第三节翻译的详细机制
      - 一、细菌的蛋白质合成
      - 二、真核生物的细胞质翻译系统
      - 三、细胞器翻译系统
      - 四、古菌的翻译系统
      - Box18.1 蛋白质生物合成为什么需要钾离子？
    - 第四节翻译的质量控制
      - 一、细菌的翻译质量控制
      - 二、真核生物的翻译质量控制
      - 三、古菌的翻译质量控制
    - 第五节翻译的抑制剂
      - 一、细菌翻译系统的抑制剂
      - 二、真核翻译系统的抑制剂
      - 三、既抑制细菌又抑制古菌和真核翻译系统的抑制剂
      - Box18.2 你相信细胞之间可以转移mRNA并被翻译这样的事情吗？
    - 第六节翻译后加工
    - 第七节蛋白质翻译后的定向转运与分拣
      - 一、通过SRP信号肽起作用的蛋白质的定向与分拣
      - 二、不依赖于SRP信号肽的蛋白质的翻译后定向
      - 科学故事遗传密码的破译之路
  - 第十九章基因表达的调控
    - 第一节原核生物的基因表达调控
      - 一、在DNA水平上的调控
      - 二、在转录水平上的调控
      - 三、在翻译水平上的调控
      - 四、环境信号诱发的基因表达调控
      - 五、在基因组水平上的全局调控
      - Box19.1 噬菌体与细菌之间的较量
    - 第二节真核生物的基因表达调控
      - 一、在染色质水平上的基因表达调控
      - 二、在DNA水平上的基因表达调控
      - 三、在转录水平上的基因表达调控
      - 四、转录后加工水平上的基因表达调控
      - 五、翻译及翻译后加工水平上的调控
      - Box19.2 生化研究动态——我们吃的不仅是食物，也许还有“信息”
  - 第二十章分子生物学方法
    - 第一节重组DNA技术简介
      - 一、基因克隆的载体
      - 二、将外源基因或序列导入载体的工具
      - 三、宿主细胞
      - 四、将重组DNA引入到宿主细胞的途径
      - 五、重组体的选择和筛选
      - Box20.1 自然界有RNA质粒吗？
    - 第二节重组DNA技术的详细步骤
      - 一、外源DNA序列和目的基因的获得
      - 二、目的基因与载体的连接
      - 三、重组DNA导入特定的宿主细胞
      - 四、含有目的基因序列的克隆的筛选与鉴定
    - 第三节重组DNA技术的应用
      - 一、文库的建立
      - 二、DNA序列分析
      - 三、表达外源蛋白
      - 四、转基因动物、植物及转基因食品
      - 五、基因治疗
      - 六、基因功能的研究
      - 七、寻找未知基因
    - 第四节聚合酶链反应
      - Box20.2 镜像PCR系统的建立
    - 第五节蛋白质工程
      - 一、随机突变
      - 二、定点突变
    - 第六节研究蛋白质之间相互作用的主要方法与技术
    - 第七节研究核酸与蛋白质之间相互作用的主要方法和技术
    - 第八节基因芯片和蛋白质芯片技术
      - 一、基因芯片
      - 二、蛋白质芯片
    - 第九节基因组编辑技术
      - 科学故事 CRISPR/Cas9系统的“前身今世”

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