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植物小RNA

样章
作者：
莫蓓莘 刘琳 于宇 译
定价：
86.00元
ISBN：
978-7-04-055466-3
版面字数：
520.000千字
开本：
16开
全书页数：
暂无
装帧形式：
平装
重点项目：
暂无
出版时间：
2021-10-18
读者对象：
高等教育
一级分类：
生物科学
二级分类：
分子生物学/基因组学
暂无
  • 前辅文
  • 第1篇 基础知识
    • 第1章 植物小RNA 简介
      • 前言
      • 小RNA 的发现史
      • 小RNA 的多样性
      • miRNA
      • siRNA
      • phasiRNA
      • 小RNA 的移动
      • 未来展望
      • 致谢
      • 网上资源
    • 第2章 小RNA 的类型和多样性
      • 小的调控RNA：历史的里程碑
      • 植物内源小RNA 的分类
      • 发夹小RNA 和miRNA
      • 天然反义转录物siRNA（nat-siRNA）
      • 次级和反式作用siRNA
      • 异染色质siRNA
      • 网上资源
    • 第3章 小RNA 的生物合成：分子途径和调控机制
      • DNA 依赖的RNA 聚合酶
      • RNA 依赖的RNA 聚合酶
      • Dicer
      • 植物中的Argonaute 蛋白
      • AGO
      • AGO
      • AGO
      • AGO
      • AGO2 和AGO
      • AGO
      • AGO
      • AGO8 和AGO
      • AGO- 小RNA 分选和生物学功能的决定因素
      • 小RNA 在跨代表观遗传中的作用
      • 小RNA 途径之间的相互关系
      • 小RNA 分析：“干实验室”带来的计算挑战
      • 网上资源
    • 第4章 基于转录组的植物小RNA 鉴定：对强大预测计算程序的需求
      • 前言
      • 小RNA 测序对植物样本的要求
      • RNA 测序方法的类型
      • 基于dUTP 的链特异性RNA 测序
      • 采用RNA 测序进行集群分离分析（BSA）
      • 双链RNA 测序
      • 差异性RNA 测序
      • RNA 测序数据的要素及分析
      • 原始读数
      • 读数比对
      • 定量分析
      • 转录物鉴定
      • 序列比对
      • 差异基因表达分析
      • 可变剪接鉴定
      • 基因融合鉴定
      • 植物小RNA 注释的难点与解决方案
      • 经验工具包和数据库
      • FASTX
      • miRCat
      • SiloCo
      • miRBASE
      • TAPIR
      • 新兴的算法
      • 利用时间曲线数据验证表达模式
      • 标准化和对数比率变换法
      • 基于RNA Seq 数据分析基本步骤的可用工具和数据库
      • 质量控制
      • 读数修剪与接头的去除
      • 错误校正
      • 偏差纠正
      • 其他任务/ 预处理数据
      • 比对工具
      • 从头剪接比对工具
      • 标准化、定量分析和差异表达
      • 开放（免费）来源的工具
      • 可变剪接分析
      • 差异表达异构体/ 转录物的使用
      • 融合基因/ 嵌合体/ 易位发现器/ 结构变异
      • 单细胞RNA Seq
      • 集成包
      • 基因组介导的组装工具
      • 共表达网络
      • 可视化工具
      • 功能、网络和通路分析工具
      • 用于分析植物转录组数据库的链接
      • 案例研究：黑吉豆的转录组分析和miRNA 鉴定
      • 研究背景
      • 样品制备和测序
      • 从测序数据中筛选和鉴定miRNA
      • 已知miRNA 和新型miRNA 序列的鉴定
      • miRNA 靶基因预测、基因本体分类和靶基因定量分析
      • 定量分析不同组织中的miRNA 以研究其组织特异性表达
      • 空白对照（MC）和接种MYMIV（MI）数据集中miRNA 的表达模式
      • 在MYMIV 易感性和抗性背景中对miRNA 靶基因进行qPCR 验证
      • 网上资源
  • 第2篇 小RNA 的表达和调控机制
    • 第5章 RNA 干扰在种子萌发中的作用
      • VI 目录
      • 前言
      • 种子萌发机理
      • 种子萌发的阶段
      • 影响种子萌发的因素
      • RNA 沉默的现象
      • RNA 沉默的机制
      • miRNA
      • tasi-RNA
      • 小RNA 在种子萌发中的作用
      • miRNA 作为汇聚调控节点
      • 总结
      • 致谢
      • 网上资源
    • 第6章 小RNA 在植物种子萌发中的重要性
      • 种子萌发的简要介绍
      • 与拟南芥种子萌发相关的miRNA
      • 与作物种子萌发相关的miRNA
      • 与种子萌发相关的干扰小RNA
      • 网上资源
    • 第7章 小RNA 在植物代谢中的重要作用
      • 前言
      • 植物小RNA 的主要类型
      • 植物小RNA 的生物合成：miRNA 和干扰小RNA
      • 小RNA 在胁迫条件下调控植物代谢的多种功能
      • miRNA 在ABA 介导的胁迫响应中的作用
      • miRNA 介导的对干旱胁迫和盐胁迫的适应性反应
      • miRNA 调控冷胁迫和热胁迫耐受性
      • miRNA 在低氧和氧化胁迫中的表达
      • miRNA 对营养稳态的响应
      • 小RNA 在调控植物代谢中的作用
      • miRNA 介导的植物激素信号调控
      • miRNA： 调控植物代谢的转录因子
      • miRNA 在植物次生代谢物合成中的作用
      • 干扰小RNA 在植物胁迫反应中的调控作用
      • 结论及发展前景
      • 网上资源
      • 目录VII
    • 第8章 小RNA 在调控多种生物胁迫耐受性中的作用
      • 小RNA： 发现、分类与生物发生
      • 分类
      • miRNA 和isomiR
      • ta-siRNA
      • nat-siRNA
      • 异染色质siRNA
      • 病原体来源的小RNA 和类miRNA 分子
      • 生物起源
      • 用于小RNA 研究的方法
      • 用于小RNA 预测的参数
      • 植物miRNA 和病原菌milR
      • 植物ta-siRNA
      • 植物的isomiR
      • 小RNA 的可用数据库
      • 小RNA 介导的植物生物胁迫反应
      • 小RNA 介导的植物对昆虫的反应
      • 小RNA 介导的植物对真菌的反应
      • 小RNA 介导的植物抗病毒反应
      • 小RNA 介导的植物对细菌的反应
      • 小RNA 介导的植物对非生物胁迫的反应
      • 小RNA 和农业改良
      • 小RNA 喷雾剂
      • 结论
      • 网上资源
    • 第9章 小RNA 在植物病毒致病过程中的作用
      • 前言
      • siRNA 介导和miRNA 介导的抗病毒机制
      • miRNA 在植物抗病毒防御中的作用
      • SiRNA 介导的基因沉默在植物抗病毒中应用
      • siRNA 在植物病毒致病过程中的调控
      • siRNA 在抵抗细菌性病害中的作用
      • siRNA 对真菌性病害的防御作用
      • 网上资源
    • 第10章 小RNA 与盐胁迫耐受性
      • 前言
      • VIII 目录
      • 植物小RNA：类型与生物起源
      • miRNA
      • siRNA
      • 小RNA 在盐胁迫响应中的作用
      • 结论与未来展望
      • 致谢
      • 网上资源
    • 第11章 小RNA 与冷胁迫耐受性
      • 前言
      • 冷胁迫感应与第二信使
      • 冷驯化的机制
      • 小RNA 与冷胁迫耐受性
      • miRNA 和siRNA 的生物合成
      • miRNA 在冷胁迫耐受性中的作用
      • siRNA 在冷胁迫耐受性中的作用
      • 冷胁迫响应基因
      • 结论
      • 网上资源
    • 第12章 miRNA 在干旱胁迫耐受性中的功能
      • 前言
      • 干旱和干旱耐受机制
      • 干旱逃逸
      • 干旱避免
      • 干旱耐受
      • 干旱耐受的生理生化机制
      • 耐旱性的分子基础
      • miRNA 对干旱胁迫的响应
      • 响应干旱胁迫的miRNA 的靶标
      • miRNA 对干旱胁迫耐受性的贡献
      • 结论和未来展望
      • 网上资源
    • 第13章 小RNA 对植物光合作用和营养生长的调控作用
      • 前言
      • 小RNA 在营养生长中的作用
      • 茎尖分生组织基因的表达调控
      • 叶片近- 远轴极性
      • 目录IX
      • 叶片形态和大小
      • 保卫细胞的形成
      • 叶片衰老
      • 营养生长到生殖生长的时相转变
      • 根部性状的调控
      • 小RNA 在光合作用中的调控功能
      • 小RNA 在调控光合作用和营养生长中的应用前景
      • 水稻
      • 烟草
      • 马铃薯
      • 玉米
      • 豆类
      • 小麦
      • 杨树
      • 番茄
      • 结论
      • 网上资源
    • 第14章 小RNA 在植物热胁迫耐受性中的调控作用
      • 前言
      • miRNA 的生物合成
      • miRNA 如何调节热胁迫响应？
      • 植物中参与热胁迫响应的miRNA
      • 谷类作物中的miRNA 家族及其调控途径
      • miR156 家族
      • miR159 家族
      • miR160 家族
      • miR164 家族
      • miR166 家族
      • miR167 家族
      • miR168 家族
      • miR169 家族
      • miR172 家族
      • miR319 家族
      • miR393 家族
      • miR395 家族
      • miR397 家族
      • miR398 家族
      • miR408 家族
      • 利用miRNA 技术改良作物
      • 靶标模拟
      • 人工miRNA
      • 利用基因组编辑技术对miRNA 的调控
      • 结论
      • 致谢
      • 网上资源
    • 第15章 小RNA 在植物与微生物相互作用中的调控功能
      • 前言
      • 植物中小RNA 的结构多样性
      • miRNA
      • siRNA
      • miRNA 在有益微生物与植物相互作用中的调控功能
      • 有益细菌定植的植物中miRNA 的调控
      • mi RNA 在有益真菌相互作用中的调控功能
      • 小RNA 在病原性微生物与植物相互作用中的调控功能
      • 植物的免疫机制
      • 病原菌的对抗策略
      • 结论和未来展望
      • 网上资源
    • 第16章 小RNA 介导的植物- 生物互作对植物生长的调控
      • 前言
      • 小RNA 在植物防御中的作用模式
      • 小RNA 的功能
      • 小RNA 和致病机制
      • 小RNA 与植物防御
      • 细菌感染
      • 真菌感染
      • 病毒感染
      • 小RNA 与共生关系
      • 小结
      • 网上资源
    • 第17章 植物中的小RNA 和DNA 甲基化
      • 小RNA 的简要概述
      • 目录XI
      • 转录基因沉默
      • DNA 甲基化和去甲基化
      • DNA 甲基化
      • 主动的DNA 去甲基化
      • AGO 蛋白及其功能
      • AGO 蛋白家族
      • 拟南芥中AGO 的功能
      • 移动的小RNA
      • 植物有性生殖中的小RNA 和表观重组
      • miRNA 和DNA 甲基化
      • 拟南芥中介导DNA 甲基化但不依赖Dicer 的siRNA 生物合成途径
      • 小RNA 和杂种优势
      • DNA 甲基化和果肉成熟
      • 关于DNA 甲基化的辛普森悖论
      • 结束语
      • 致谢
      • 网上资源
  • 第3篇 小RNA 的应用
    • 第18章 植物中的小RNA 调控：技术和最新进展
      • 前言
      • 小RNA 沉默途径
      • miRNA 途径
      • siRNA 途径
      • RNA 沉默相关的其他途径
      • 植物中最新的RNA 沉默技术
      • 发夹RNA 转基因（HpRNA）诱导的RNA 沉默
      • 人工miRNA（amiRNA）技术
      • 病毒诱导的基因沉默（VIGS）
      • RNA 干扰的应用
      • 作物改良和营养价值
      • RNAi 在生物胁迫中的应用
      • RNAi 在次生代谢物生物合成途径中的作用
      • RNAi 在无籽水果生产中的应用
      • RNAi 在开发有价值的工业产品中的应用
      • XII 目录
      • RNAi 可延长保质期
      • RNAi 可抑制食用水果中的有毒化合物和过敏原
      • RNAi 在无害油生产中的应用
      • RNAi 的局限性
      • RNAi 技术的生物安全问题
      • 结论
      • 网上资源
    • 第19章 植物miRNA 在盐胁迫下的规律性功能
      • 前言
      • 盐胁迫下miRNA 的丰度和动态
      • 盐胁迫下miRNA 和相关靶基因的调控
      • 植物中miRNA 介导的耐盐性的发展
      • 结论与展望
      • 网上资源
    • 第20章 基于小RNA 技术的生物胁迫耐受性植物
      • 植物生物胁迫
      • 植物对生物胁迫因素的免疫反应
      • 与小RNA 相关的生物胁迫响应
      • 小RNA 在病毒- 植物互作中的作用
      • 小RNA 在细菌- 植物互作中的作用
      • 小RNA 在真菌- 植物互作中的作用
      • 小RNA 在线虫- 植物互作中的作用
      • 小RNA 在食草动物- 植物互作中的作用
      • 小RNA 在生物抗性中的应用
      • 人工miRNA 的应用
      • 位点特异性基因组编辑的应用
      • 网上资源
    • 第21章 miRNA 在提高果实品质中的应用
      • 前言
      • miRNA 和水果质地
      • miRNA 和水果着色
      • miRNA 和果实发育
      • miRNA 和果实成熟
      • 结束语和未来前景
      • 网上资源
      • 目录XIII
    • 第22章 小RNA 对植物的生理影响
      • 植物生理的基础
      • 生理发育的调节
      • 植物小RNA 的发现
      • 基于RNA 来源对小RNA 的分类
      • 基于RNA 合成方式对小RNA 的分类
      • 小RNA 作用的基本方式
      • 小RNA 在生理发育过程中的调控作用
      • 染色质修饰
      • 靶标降解
      • 降低翻译效率
      • 小RNA 介导的生理发育调控
      • 营养生长
      • 时相转变
      • 花的发育
      • 种子的发育、成熟和萌发
      • 结论与展望
      • 网上资源
    • 第23章 小RNA 技术在植物非生物胁迫中的应用
      • 前言
      • 小RNA 技术在植物中的应用
      • RNAi 的一般机制
      • 植物miRNA
      • siRNA 调控植物非生物胁迫耐受性
      • miRNA 调控植物非生物胁迫耐受性
      • 总结
      • 网上资源
  • 第4篇 未来展望
    • 第24章 小RNA 技术面临的挑战
      • 植物中的小RNA：正在发展的领域
      • RNA 干扰：小RNA 技术的基础
      • 小RNA 技术：潜力巨大
      • 植物病虫害防御
      • 代谢通路的重塑
      • 非生物胁迫响应
      • 雄性不育
      • 小RNA 技术：面临的挑战和障碍
      • 脱靶效应
      • 转基因的稳定性
      • 双链 RNA（ dsRNA） 存在于宿主植物体内的持久性
      • 转基因植物的食物风险评估
      • 转基因植物的生物安全性评价
      • 未来前景
      • 利用生物信息学方法优化基因沉默策略
      • 体外喷施诱导基因沉默技术
      • CRISPR/Cas9：编辑植物基因组的平台
      • 总结
      • 网上资源
    • 第25章 小RNA 技术在作物改良中的应用前景
      • 前言
      • 植物中各种小RNA 通路概述
      • 关于小RNA 测序技术和转运研究的展望
      • 小RNA 介导的基因沉默技术在作物改良应用中的进展与挑战
      • 植物的胁迫记忆与遗忘
      • 植物中小RNA 介导的表观遗传工程和RNA 编辑
      • 小RNA 的跨界传输及其在植物病虫害防御中的应用
      • 结论
      • 致谢
      • 网上资源
    • 索引

植物小RNA数字课程是与教材一体化设计的配套数字资源，是教材的有力补充。本数字课程包括彩色插图、参考文献及拓展阅读等丰富的内容，建议教师根据教学目标引导学生充分利用这些资源，进行拓展学习。

课程网址： http://abook.hep.com.cn/55466

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