植物小RNA

样章

作者：

莫蓓莘刘琳于宇译

定价：

86.00 元

版面字数：

520千字

开本：

16开

装帧形式：

平装

版次：

1

最新版次
印刷时间：

2021年

ISBN：

978-7-04-055466-3

物料号：

55466-00

出版时间：

2021-10-18

读者对象：

高等教育

一级分类：

生物科学

二级分类：

分子生物学/基因组学

册数：

暂无

目录
- 前辅文
- 第1篇基础知识
  - 第1章植物小RNA 简介
    - 前言
    - 小RNA 的发现史
    - 小RNA 的多样性
    - miRNA
    - siRNA
    - phasiRNA
    - 小RNA 的移动
    - 未来展望
    - 致谢
    - 网上资源
  - 第2章小RNA 的类型和多样性
    - 小的调控RNA：历史的里程碑
    - 植物内源小RNA 的分类
    - 发夹小RNA 和miRNA
    - 天然反义转录物siRNA（nat-siRNA）
    - 次级和反式作用siRNA
    - 异染色质siRNA
    - 网上资源
  - 第3章小RNA 的生物合成：分子途径和调控机制
    - DNA 依赖的RNA 聚合酶
    - RNA 依赖的RNA 聚合酶
    - Dicer
    - 植物中的Argonaute 蛋白
    - AGO
    - AGO
    - AGO
    - AGO
    - AGO2 和AGO
    - AGO
    - AGO
    - AGO8 和AGO
    - AGO- 小RNA 分选和生物学功能的决定因素
    - 小RNA 在跨代表观遗传中的作用
    - 小RNA 途径之间的相互关系
    - 小RNA 分析：“干实验室”带来的计算挑战
    - 网上资源
  - 第4章基于转录组的植物小RNA 鉴定：对强大预测计算程序的需求
    - 前言
    - 小RNA 测序对植物样本的要求
    - RNA 测序方法的类型
    - 基于dUTP 的链特异性RNA 测序
    - 采用RNA 测序进行集群分离分析（BSA）
    - 双链RNA 测序
    - 差异性RNA 测序
    - RNA 测序数据的要素及分析
    - 原始读数
    - 读数比对
    - 定量分析
    - 转录物鉴定
    - 序列比对
    - 差异基因表达分析
    - 可变剪接鉴定
    - 基因融合鉴定
    - 植物小RNA 注释的难点与解决方案
    - 经验工具包和数据库
    - FASTX
    - miRCat
    - SiloCo
    - miRBASE
    - TAPIR
    - 新兴的算法
    - 利用时间曲线数据验证表达模式
    - 标准化和对数比率变换法
    - 基于RNA Seq 数据分析基本步骤的可用工具和数据库
    - 质量控制
    - 读数修剪与接头的去除
    - 错误校正
    - 偏差纠正
    - 其他任务/ 预处理数据
    - 比对工具
    - 从头剪接比对工具
    - 标准化、定量分析和差异表达
    - 开放（免费）来源的工具
    - 可变剪接分析
    - 差异表达异构体/ 转录物的使用
    - 融合基因/ 嵌合体/ 易位发现器/ 结构变异
    - 单细胞RNA Seq
    - 集成包
    - 基因组介导的组装工具
    - 共表达网络
    - 可视化工具
    - 功能、网络和通路分析工具
    - 用于分析植物转录组数据库的链接
    - 案例研究：黑吉豆的转录组分析和miRNA 鉴定
    - 研究背景
    - 样品制备和测序
    - 从测序数据中筛选和鉴定miRNA
    - 已知miRNA 和新型miRNA 序列的鉴定
    - miRNA 靶基因预测、基因本体分类和靶基因定量分析
    - 定量分析不同组织中的miRNA 以研究其组织特异性表达
    - 空白对照（MC）和接种MYMIV（MI）数据集中miRNA 的表达模式
    - 在MYMIV 易感性和抗性背景中对miRNA 靶基因进行qPCR 验证
    - 网上资源
- 第2篇小RNA 的表达和调控机制
  - 第5章 RNA 干扰在种子萌发中的作用
    - VI 目录
    - 前言
    - 种子萌发机理
    - 种子萌发的阶段
    - 影响种子萌发的因素
    - RNA 沉默的现象
    - RNA 沉默的机制
    - miRNA
    - tasi-RNA
    - 小RNA 在种子萌发中的作用
    - miRNA 作为汇聚调控节点
    - 总结
    - 致谢
    - 网上资源
  - 第6章小RNA 在植物种子萌发中的重要性
    - 种子萌发的简要介绍
    - 与拟南芥种子萌发相关的miRNA
    - 与作物种子萌发相关的miRNA
    - 与种子萌发相关的干扰小RNA
    - 网上资源
  - 第7章小RNA 在植物代谢中的重要作用
    - 前言
    - 植物小RNA 的主要类型
    - 植物小RNA 的生物合成：miRNA 和干扰小RNA
    - 小RNA 在胁迫条件下调控植物代谢的多种功能
    - miRNA 在ABA 介导的胁迫响应中的作用
    - miRNA 介导的对干旱胁迫和盐胁迫的适应性反应
    - miRNA 调控冷胁迫和热胁迫耐受性
    - miRNA 在低氧和氧化胁迫中的表达
    - miRNA 对营养稳态的响应
    - 小RNA 在调控植物代谢中的作用
    - miRNA 介导的植物激素信号调控
    - miRNA：调控植物代谢的转录因子
    - miRNA 在植物次生代谢物合成中的作用
    - 干扰小RNA 在植物胁迫反应中的调控作用
    - 结论及发展前景
    - 网上资源
    - 目录VII
  - 第8章小RNA 在调控多种生物胁迫耐受性中的作用
    - 小RNA：发现、分类与生物发生
    - 分类
    - miRNA 和isomiR
    - ta-siRNA
    - nat-siRNA
    - 异染色质siRNA
    - 病原体来源的小RNA 和类miRNA 分子
    - 生物起源
    - 用于小RNA 研究的方法
    - 用于小RNA 预测的参数
    - 植物miRNA 和病原菌milR
    - 植物ta-siRNA
    - 植物的isomiR
    - 小RNA 的可用数据库
    - 小RNA 介导的植物生物胁迫反应
    - 小RNA 介导的植物对昆虫的反应
    - 小RNA 介导的植物对真菌的反应
    - 小RNA 介导的植物抗病毒反应
    - 小RNA 介导的植物对细菌的反应
    - 小RNA 介导的植物对非生物胁迫的反应
    - 小RNA 和农业改良
    - 小RNA 喷雾剂
    - 结论
    - 网上资源
  - 第9章小RNA 在植物病毒致病过程中的作用
    - 前言
    - siRNA 介导和miRNA 介导的抗病毒机制
    - miRNA 在植物抗病毒防御中的作用
    - SiRNA 介导的基因沉默在植物抗病毒中应用
    - siRNA 在植物病毒致病过程中的调控
    - siRNA 在抵抗细菌性病害中的作用
    - siRNA 对真菌性病害的防御作用
    - 网上资源
  - 第10章小RNA 与盐胁迫耐受性
    - 前言
    - VIII 目录
    - 植物小RNA：类型与生物起源
    - miRNA
    - siRNA
    - 小RNA 在盐胁迫响应中的作用
    - 结论与未来展望
    - 致谢
    - 网上资源
  - 第11章小RNA 与冷胁迫耐受性
    - 前言
    - 冷胁迫感应与第二信使
    - 冷驯化的机制
    - 小RNA 与冷胁迫耐受性
    - miRNA 和siRNA 的生物合成
    - miRNA 在冷胁迫耐受性中的作用
    - siRNA 在冷胁迫耐受性中的作用
    - 冷胁迫响应基因
    - 结论
    - 网上资源
  - 第12章 miRNA 在干旱胁迫耐受性中的功能
    - 前言
    - 干旱和干旱耐受机制
    - 干旱逃逸
    - 干旱避免
    - 干旱耐受
    - 干旱耐受的生理生化机制
    - 耐旱性的分子基础
    - miRNA 对干旱胁迫的响应
    - 响应干旱胁迫的miRNA 的靶标
    - miRNA 对干旱胁迫耐受性的贡献
    - 结论和未来展望
    - 网上资源
  - 第13章小RNA 对植物光合作用和营养生长的调控作用
    - 前言
    - 小RNA 在营养生长中的作用
    - 茎尖分生组织基因的表达调控
    - 叶片近- 远轴极性
    - 目录IX
    - 叶片形态和大小
    - 保卫细胞的形成
    - 叶片衰老
    - 营养生长到生殖生长的时相转变
    - 根部性状的调控
    - 小RNA 在光合作用中的调控功能
    - 小RNA 在调控光合作用和营养生长中的应用前景
    - 水稻
    - 烟草
    - 马铃薯
    - 玉米
    - 豆类
    - 小麦
    - 杨树
    - 番茄
    - 结论
    - 网上资源
  - 第14章小RNA 在植物热胁迫耐受性中的调控作用
    - 前言
    - miRNA 的生物合成
    - miRNA 如何调节热胁迫响应？
    - 植物中参与热胁迫响应的miRNA
    - 谷类作物中的miRNA 家族及其调控途径
    - miR156 家族
    - miR159 家族
    - miR160 家族
    - miR164 家族
    - miR166 家族
    - miR167 家族
    - miR168 家族
    - miR169 家族
    - miR172 家族
    - miR319 家族
    - miR393 家族
    - miR395 家族
    - miR397 家族
    - miR398 家族
    - miR408 家族
    - 利用miRNA 技术改良作物
    - 靶标模拟
    - 人工miRNA
    - 利用基因组编辑技术对miRNA 的调控
    - 结论
    - 致谢
    - 网上资源
  - 第15章小RNA 在植物与微生物相互作用中的调控功能
    - 前言
    - 植物中小RNA 的结构多样性
    - miRNA
    - siRNA
    - miRNA 在有益微生物与植物相互作用中的调控功能
    - 有益细菌定植的植物中miRNA 的调控
    - mi RNA 在有益真菌相互作用中的调控功能
    - 小RNA 在病原性微生物与植物相互作用中的调控功能
    - 植物的免疫机制
    - 病原菌的对抗策略
    - 结论和未来展望
    - 网上资源
  - 第16章小RNA 介导的植物- 生物互作对植物生长的调控
    - 前言
    - 小RNA 在植物防御中的作用模式
    - 小RNA 的功能
    - 小RNA 和致病机制
    - 小RNA 与植物防御
    - 细菌感染
    - 真菌感染
    - 病毒感染
    - 小RNA 与共生关系
    - 小结
    - 网上资源
  - 第17章植物中的小RNA 和DNA 甲基化
    - 小RNA 的简要概述
    - 目录XI
    - 转录基因沉默
    - DNA 甲基化和去甲基化
    - DNA 甲基化
    - 主动的DNA 去甲基化
    - AGO 蛋白及其功能
    - AGO 蛋白家族
    - 拟南芥中AGO 的功能
    - 移动的小RNA
    - 植物有性生殖中的小RNA 和表观重组
    - miRNA 和DNA 甲基化
    - 拟南芥中介导DNA 甲基化但不依赖Dicer 的siRNA 生物合成途径
    - 小RNA 和杂种优势
    - DNA 甲基化和果肉成熟
    - 关于DNA 甲基化的辛普森悖论
    - 结束语
    - 致谢
    - 网上资源
- 第3篇小RNA 的应用
  - 第18章植物中的小RNA 调控：技术和最新进展
    - 前言
    - 小RNA 沉默途径
    - miRNA 途径
    - siRNA 途径
    - RNA 沉默相关的其他途径
    - 植物中最新的RNA 沉默技术
    - 发夹RNA 转基因（HpRNA）诱导的RNA 沉默
    - 人工miRNA（amiRNA）技术
    - 病毒诱导的基因沉默（VIGS）
    - RNA 干扰的应用
    - 作物改良和营养价值
    - RNAi 在生物胁迫中的应用
    - RNAi 在次生代谢物生物合成途径中的作用
    - RNAi 在无籽水果生产中的应用
    - RNAi 在开发有价值的工业产品中的应用
    - XII 目录
    - RNAi 可延长保质期
    - RNAi 可抑制食用水果中的有毒化合物和过敏原
    - RNAi 在无害油生产中的应用
    - RNAi 的局限性
    - RNAi 技术的生物安全问题
    - 结论
    - 网上资源
  - 第19章植物miRNA 在盐胁迫下的规律性功能
    - 前言
    - 盐胁迫下miRNA 的丰度和动态
    - 盐胁迫下miRNA 和相关靶基因的调控
    - 植物中miRNA 介导的耐盐性的发展
    - 结论与展望
    - 网上资源
  - 第20章基于小RNA 技术的生物胁迫耐受性植物
    - 植物生物胁迫
    - 植物对生物胁迫因素的免疫反应
    - 与小RNA 相关的生物胁迫响应
    - 小RNA 在病毒- 植物互作中的作用
    - 小RNA 在细菌- 植物互作中的作用
    - 小RNA 在真菌- 植物互作中的作用
    - 小RNA 在线虫- 植物互作中的作用
    - 小RNA 在食草动物- 植物互作中的作用
    - 小RNA 在生物抗性中的应用
    - 人工miRNA 的应用
    - 位点特异性基因组编辑的应用
    - 网上资源
  - 第21章 miRNA 在提高果实品质中的应用
    - 前言
    - miRNA 和水果质地
    - miRNA 和水果着色
    - miRNA 和果实发育
    - miRNA 和果实成熟
    - 结束语和未来前景
    - 网上资源
    - 目录XIII
  - 第22章小RNA 对植物的生理影响
    - 植物生理的基础
    - 生理发育的调节
    - 植物小RNA 的发现
    - 基于RNA 来源对小RNA 的分类
    - 基于RNA 合成方式对小RNA 的分类
    - 小RNA 作用的基本方式
    - 小RNA 在生理发育过程中的调控作用
    - 染色质修饰
    - 靶标降解
    - 降低翻译效率
    - 小RNA 介导的生理发育调控
    - 营养生长
    - 时相转变
    - 花的发育
    - 种子的发育、成熟和萌发
    - 结论与展望
    - 网上资源
  - 第23章小RNA 技术在植物非生物胁迫中的应用
    - 前言
    - 小RNA 技术在植物中的应用
    - RNAi 的一般机制
    - 植物miRNA
    - siRNA 调控植物非生物胁迫耐受性
    - miRNA 调控植物非生物胁迫耐受性
    - 总结
    - 网上资源
- 第4篇未来展望
  - 第24章小RNA 技术面临的挑战
    - 植物中的小RNA：正在发展的领域
    - RNA 干扰：小RNA 技术的基础
    - 小RNA 技术：潜力巨大
    - 植物病虫害防御
    - 代谢通路的重塑
    - 非生物胁迫响应
    - 雄性不育
    - 小RNA 技术：面临的挑战和障碍
    - 脱靶效应
    - 转基因的稳定性
    - 双链 RNA（ dsRNA）存在于宿主植物体内的持久性
    - 转基因植物的食物风险评估
    - 转基因植物的生物安全性评价
    - 未来前景
    - 利用生物信息学方法优化基因沉默策略
    - 体外喷施诱导基因沉默技术
    - CRISPR/Cas9：编辑植物基因组的平台
    - 总结
    - 网上资源
  - 第25章小RNA 技术在作物改良中的应用前景
    - 前言
    - 植物中各种小RNA 通路概述
    - 关于小RNA 测序技术和转运研究的展望
    - 小RNA 介导的基因沉默技术在作物改良应用中的进展与挑战
    - 植物的胁迫记忆与遗忘
    - 植物中小RNA 介导的表观遗传工程和RNA 编辑
    - 小RNA 的跨界传输及其在植物病虫害防御中的应用
    - 结论
    - 致谢
    - 网上资源
  - 索引

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